Vnitrozemské nádrže se liší velikostí, hloubkou, množstvím a povahou látek v nich rozpuštěných, rychlostí proudění vody, povahou dna, teplotou vody a dalšími charakteristikami. Jejich kombinace vytváří velmi odlišná stanoviště, obývaná širokou škálou druhů. Počet druhů se obecně zvyšuje s tím, jak se zvětšuje plocha vodního útvaru nebo povodí, protože větší vodní útvary mohou podporovat více různých stanovišť, čímž se zvyšuje rozmanitost. Druhovou bohatost však kromě velikosti nádrže ovlivňuje také například teplota a hloubka vody, stabilita vodní hladiny a charakteristika dna [1]. Biota nádrží se skládá z různých forem: od bakterií a planktonu neviditelných pouhým okem, různého hmyzu a měkkýšů a konče rybami a dokonce i mnohametrovými rostlinami.
Biota tekoucích vod
Biota tekoucích nádrží je vždy úzce spjata se dnem a břehy nádrže. Nejrozmanitějšími biotopy jsou hraniční zóny s různým prostředím (včetně pevniny a vody). Řeky hraničí s rozšířenou pevninou a jsou obecně mělké, což z nich činí druhově nejbohatší typ vnitrozemského vodního útvaru [2].
Fytoplankton v estonských řekách je poměrně bohatý na druhy – bylo identifikováno více než 400 taxonů, většinou řas – ale jejich biomasa je poměrně malá kvůli rychlé výměně vody v řekách (s výjimkou dolních toků delších, pomalu tekoucích řek) [3].
Typické říční mikroorganismy se skládají z houštin nebo perifytonu, který se skládá z bakterií, řas, hub a malých živočichů připojených ke dnu řeky, podmořských skal nebo rostlin. Z přerostlých taxonů v Estonsku byly sice identifikovány pouze mořské rozsivky, ale i těchto více než 580 taxonů bylo identifikováno – tedy více než druhů nalezených ve fytoplanktonu jako celku [2].
Druhová bohatost a množství velké vegetace v řekách se liší v závislosti na rychlosti a množství proudění, obsahu živin ve vodě a dalších faktorech. Z rozsáhlé vegetace je známo 124 druhů cévnatých rostlin, 22 druhů mechů a 34 druhů makrořas. Rostliny a velké řasy, viditelné pouhým okem, jsou nejhojnějšími druhy v mělkých řekách a na stromech [2].
Počet taxonů velkých bezobratlých (bezobratlí viditelní pouhým okem) v estonských řekách je asi 1000. Patří sem především bentický hmyz (např. bentické zvonky, chironomidy), pavoukovci, korýši (např. raci), měkkýši (např. škrkavky). ploštěnci a kroužkovci, houby a mechovky [2].
V estonských řekách žije nejméně 45 druhů ryb (včetně vřetenovitých – mihulí), které zde žijí trvale nebo sem pravidelně připlouvají, stejně jako příležitostní obyvatelé. Vzhledem k pestrým životním podmínkám se v řekách vyskytuje více druhů ryb než v jezerech. Stěhovavé ryby navíc pravidelně plavou z jezer a moří do řek a naopak. Nejběžnějšími druhy ryb jsou siven, střevle, štika, plotice a okoun [2].
Kromě toho se v řekách můžete setkat s užovkou obecnou nebo v řekách zimujícími skokany. Nejznámějšími ptáky spojenými s řekami jsou kachny, brodiví ptáci, skokan obecný a ledňáček říční, ze savců pak bobr, vydra, norek, norek americký, ondatra pižmová, hraboš vodní a rejsek obecný. Všechny však mohou žít ve stojaté vodě [2].
Biota jezer
Lví podíl na jezerní vegetaci tvoří rozsivky, zelené řasy a zlaté řasy a také modrozelené řasy. Ve skutečnosti jsou to bakterie, jejichž množení nebo kvetení může způsobit, že vodní útvar je pro člověka toxický. Rozložení fytoplanktonu závisí především na světle, živinách, pohybu vody a teplotě. V zimě je abundance fytoplanktonu malá, druhová skladba je nejbohatší v létě [4].
Počet zooplanktonu v jezerech je také největší v létě. Nejpočetnější jsou jednobuněční prvoci. Nejčastějšími taxony mnohobuněčných druhů jsou korýši (až 200 různých druhů), perloočky a veslonôžky (oba asi 70 druhů) [4].
Perifyton se vyskytuje v mělkých jezerech téměř všude, kde je vhodné dno a dostatek světla. Perifyton obsahuje jak jednobuněčné mořské rozsivky, tak vláknité zelené a červené řasy až metr dlouhé. Perifyton je důležitým producentem kyslíku u dna [4].
Velké rostliny jsou v jezerech zastoupeny kvetoucími rostlinami, mechy a jaterníky, dále charopytními řasami a velkými červenými a zelenými řasami. V estonských jezerech bylo nalezeno více než 100 druhů cévnatých rostlin a asi dvacet druhů mechů a charopytních řas. Velké rostliny se dělí do čtyř typů růstových forem. Všechny části vodních rostlin jsou pod vodou (například charophyte řasy). U helofytů neboli pobřežních rostlin jsou pod vodou pouze kořeny a spodní část stonku a z vody vyčnívají listy a květy (například rákosí). U rostlin s plovoucími listy jsou kořeny a stonky pod vodou a listy leží na hladině vody (například tobolka vajec). V tomto případě se plovoucí rostliny volně pohybují po hladině vody, aniž by byly přichyceny ke dnu (například okřehek) [4].
Nejběžnějším bentosem jezer jsou měkkýši, pijavice, raci, máloštětinatci a mnoho larev hmyzu [5]. V estonských stojatých vodách lze zjevně nalézt nejméně 1000 druhů velkých bezobratlých [4].
Ve stojatých vodách Estonska žije asi 30 druhů ryb (nepočítáme-li cizí a cizí druhy). Počet druhů závisí především na ploše jezera. Druhově bohatá rybí jezera jsou Mullutu, Suurlaht, Tamula, Vagula, Lakhepera, Viljandi a Saadjärv [4].
Opeřený svět jezer je velmi rozmanitý, ale jen málo ptáků hnízdí přímo na vodě. Potápky staví plovoucí hnízda a hnízda pěnic jsou připevněna k rákosí. Mnoho druhů navštěvuje jezera při hledání potravy (racci, rybáci, kachny, labutě, volavky, orli) nebo během migrace (husy) [4].
Kromě rezidenčních savců, kteří žijí na březích jezer, jsou jezera samotná často obývána bobry, ondatrami a vydrami. Z obojživelníků se například v jezerech tře ropucha obecná. [4] Malé sladkovodní a slunci vystavené rybníky jsou důležitými hnízdišti pro mnoho obojživelníků.[6]
